Duchową i duszpasterską opiekę nad „Chrześcijańską Wspólnotą Średzką” sprawuje Zbór Kościoła Chrześcijan Baptystów w Poznaniu – „Wspólnota Kaleb”. Powoduje to, że wspólnota wpisuje się w ewangeliczny nurt chrześcijaństwa, a jednocześnie utrzymuje charakter ponadwyznaniowy.
W związku z tym nie ma wymogu bycia formalnie członkiem Kościoła Baptystów, aby współtworzyć „Chrześcijańską Wspólnotę Średzką”.